Notre équipe étudie les interactions hôte-pathogène nécessaires à l’infection et à la multiplication de virus ayant un impact sur la santé humaine. Les virus, en raison de la taille limitée de leur génome, utilisent les machineries de la cellule qu’ils infectent pour se multiplier. En pénétrant dans leur hôte, ces pathogènes reprogramment et détournent le métabolisme de cellulaire afin de produire les macromolécules nécessaires à la production de nouveaux virions. L’identification et la compréhension des interactions mises en jeu est indispensable au développement de stratégies antivirales. Nous nous intéressons en particulier aux mécanismes permettant aux virus de pénètrer dans leurs cibles cellulaires. Pour décrypter ces mécanismes, nous avons développé des cribles génétiques à l’échelle du génome et utilisons des stratégies d’analyse protéomique et modomique, des techniques moléculaires et fonctionnelles (CRISP/Cas9 KO) et d’imagerie cellulaire (microscopie en cellules vivantes, microscopie électronique). Ces stratégies nous permettent également de définir les fonctions physiologiques des facteurs cellulaires impliqués et d’évaluer l’impact de leur dysfonctionnement induit par ces virus. Nos principaux modèles d’étude sont des virus émergents et réémergents hautement pathogènes tels les alphavirus (Chikungunya, virus Mayaro), les flavivirus (virus Zika, virus Dengue), les rétrovirus (VIH). Notre équipe s’investit dans la recherche contre le SRAS-CoV2 avec le soutien financier de la SATT AxLR.
Les thèmes de recherche sont les suivants :
1. Entrée virale et transporteurs métaboliques
- Identification des facteurs d’entrée d’arbovirus émergents par crible génétique.
- Développement de stratégies antivirales ciblant le facteur d’attachement Axl.
- Caractérisation du rôle physiologique et dysfonctionnement de transporteurs métaboliques impliqués dans l’entrée virale
Stratégie de crible génétique par mutagenèse insertionnelle en cellules HAP1 pour l’identification de cofacteurs cellulaires et de facteurs de restriction de la réplication des virus à ARN
2. Interactions hôte-pathogène dans la réplication / restriction des virus émergents
- Caractérisation structurale et biogenèse des complexes de réplication des alphavirus
- Identification de nouveaux facteurs de restriction virale
A, B- Compartiments membranaires de réplication du virus Chikungunya observés par microscopie électronique à la membrane plasmique de cellules infectées. C- Visualisation de la protéine nsP1 du CHIKV (vert) dans en microscopie confocale (noyau : bleu). D- Modèle des interactions de nsP1 avec le métabolisme du cholestérol et des acides gras et de ses conséquences sur l’ancrage membranaire du complexe de réplication viral à la membrane plasmique. (Bakhache et al)
3. Métabolisme de l’ARN et virus émergents
- Empreinte épitranscriptomique des ARN viraux et cellulaires dans la réplication, le contrôle immunitaire et la pathogenèse des arbovirus
- Hélicases à ARN cellulaire et métabolisme de l’ARN viraux
Exemples de modifications détectées sur l’ARN génomique viral et les tRNA cellulaires au cours d’une infection virales et principales conséquences fonctionnelles.
Mots clés : Intéractions hôte-pathogène, récepteurs viraux, organelles de replication, métabolisme des ARN viraux, arbovirus, cribles génétiques
Responsables
Laurence BRIANT
DR2 CNRS, HDR virologie
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Jean-Luc Battini
DR2 INSERM, HDR
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En bref
Organisme(s) modèle(s)
- Virus ARN
- Arbovirus émergents (Chikungunya, Zika)
- Lentivirus (VIH, VIS)
Processus biologique étudié
- Réplication virale
- Remaniements membranaires
- Métabolisme cellulaire
- Homéostasie du phosphate
Techniques utilisées
- Cribles génétiques
- Microscopie confocale et électronique
- Virologie moléculaire
Applications médicales
- Ciblage thérapeutique des infections virales
- Maladies génétiques et calcification cérébrale
Financements
