Offres de CDD/Post-doc

2 Postdoctorants sur l’immunité innée et les virus respiratoires pour travailler sur le projet InVIRium financé par l’ERC et dirigé par Caroline Goujon

 

L’équipe Interféron et Restriction Antivirale, dirigée par Caroline Goujon, recrute 2 postdoctorants sur l’immunité innée et les virus respiratoires pour travailler sur le projet InVIRium financé par l’ERC, pour une durée de 4 et 5 ans, respectivement :

– 1 post-doctorant avec une forte expertise dans les domaines de l’immunité innée et des virus respiratoires (expérience en laboratoire BSL-3 et avec des virus respiratoires requise). Une expérience des cultures 3D d’épithéliums primaires des voies respiratoires serait un atout majeur.

– 1 post-doctorant ayant des compétences en bioinformatique (analyses scRNA-seq et NGS) et en expérimentation en ‘wet lab’, avec une expertise en virologie moléculaire.

Le projet InVIRium vise à comprendre les relations entre les virus respiratoires et leurs cellules hôtes, en utilisant des modèles très pertinents d’épithéliums des voies respiratoires cultivés à l’interface air-liquide, avec un accent particulier sur les virus respiratoires (coronavirus, virus de la grippe et virus respiratoire syncytial) et sur la restriction antivirale induite par l’interféron.

Les 2 postes seront disponibles à partir du début de l’année 2024. Les candidats doivent envoyer leur candidature, leur CV et les coordonnées d’au moins 2 personnes de référence à Caroline Goujon.

 

Post-doctoral position (2 years) in Nuclear pore biology & Immunity in Montpellier, France

                                                           

The research team “Viral Trafficking, Restriction and Innate Signaling” (VTRIS) studies virus-host cell interactions, with a focus on antiviral innate immunity and nuclear pore biology. Our models are human RNA viruses, including HIV-1, Influenza virus and flaviviruses.

We have an ANR-funded post-doctoral position to investigate the role of the nuclear pore component RanBP2 in inflammatory responses to viral infection. Mutations in the N-terminal domain of RanBP2 are associated with a rare genetic predisposition to deleterious inflammation and Acute Necrotizing Encephalopathy (ANE) following viral infection, frequently by Influenza A virus (IAV). This project seeks to uncover the mechanisms linking RanBP2 to deleterious inflammation following IAV infection by examining the CNS-specific role of RanBP2 and brain susceptibility of ANE. This project will help understand how alterations in the nuclear pore complex contribute to disease development following viral infection.

For this project, we are seeking a full-time post-doctoral researcher who will explore innate immune mechanisms in CRISPR-edited human cells and mouse models. The main techniques will include immunohistochemistry, flow cytometry/Legendplex, multiplex quantitative PCR and RNAscope in situ hybridization. Candidates must have a PhD in biological or biomedical sciences preferably in virology, immunology, or neurology. The delivery date for the PhD diploma should be between 2017 and 2024. Strong competence in molecular biology and an interest in neurogenetics would be an asset.

The candidate will integrate the IRIM institute, a lively and productive research environment entirely dedicated to research on infectious diseases. Estimated start date: January 2024. Estimated gross salary: 2,934 – 4,122 €/month depending on previous working experience.

Applicants are invited to send a cover letter and CV with the name of referees to Dr. Nathalie Arhel ().

POSTE POST-DOC  DANS L’EQUIPE MOUGEL (R2D2) : INTERACTION VIRUS/HOTE ET MICROSCOPIE EN TEMPS REEL

Nous recherchons un-e candidat-e exceptionnel-le et motivé-e pour rejoindre notre équipe et développer un nouveau projet intitulé «Imagerie en temps réel de la traduction d’une molécule unique d’ARN viral : comprendre comment le virus de la leucémie murine (MLV) détourne les voies cellulaires! ».

Comprendre comment les rétrovirus manipulent les fonctions cellulaires pour se répliquer est crucial pour concevoir des thérapies antivirales. Le projet de recherche visera à mettre en place des technologies avancées de microscopie à fluorescence en temps réel (SunTag, SunRISE) à l’échelle d’une seule molécule d’ARN viral afin de comprendre l’expression du MLV dans les cellules. Le projet sera réalisé avec la collaboration du laboratoire de Philippe Pierre à Marseille, qui a développé ces techniques.

Les candidats ayant une expertise en microscopie à fluorescence et en analyse d’images sont les bienvenus. Une expérience de la recherche en virologie serait un atout, mais n’est pas indispensable.
Date de début fin-2019 (très flexible); Contrat de 2 ans financé par Infectiopole Sud.

Visitez le site Web Infectiopole pour plus d’informations sur les critères d’éligibilité : http://www.infectiopolesud.com/bourses.html

Veuillez envoyer votre candidature complète avec lettre de motivation, CV et notes universitaires (notes et classements), avec la liste des publications, ainsi que les noms et adresses électroniques de 2-3 rapporteurs à : marylene.mougel[at]irim.cnrs.fr sous la forme d’un fichier PDF unique. Avec « Application postdoc » dans l’objet.


Post-doc H/F biologie cellulaire – membrane trafic – EV biologie – Montpellier, France

Nous recherchons un jeune chercheur post-doctorant pour rejoindre l’équipe “Dynamique Membranaire & Virus” dirigée par Raphael Gaudin et faisant parti de l’Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier, France (CNRS – UMR9004). Notre laboratoire s’intéresse à différents aspects des voies de transport intracellulaire en conditions physiologiques et pathologiques. En particulier, nous nous intéressons actuellement à la sécrétion d’entités biologiques telles que les vésicules extracellulaires et les virus. Nous avons découvert récemment un nouveau sous-type de vésicules extracellulaires contenant le morphogène Sonic Hedgehog (Shh) que nous avons appelé ART-EVs (Coulter, Dorobantu et al. Cell Rep, 2018) et nous cherchons maintenant à caractériser ces vésicules et leurs voies de sécrétion. Le projet bénéficiera de techniques d’imagerie avancées, de stratégies Crispr/Cas9 et d’autres approches de pointes maitrisées au laboratoire.

Le candidat retenu devra réaliser des expériences en laboratoire de niveau L2 et être capable de communiquer ses résultats en anglais lors de communications orales internes et en congrès. Le projet est conduit en collaboration avec deux autres laboratoires ayant des expertises en protéomiques et manipulation in vivo.

Le candidat aura soutenu récemment sa thèse de doctorat ou la soutiendra prochainement ; le candidat est spécialisé en Biologie Cellulaire et/ou « membrane traffic ». Une expérience précédente avec des exosomes ou vésicules extracellulaires est un plus. Curiosité, motivation, autonomie et capacité à résoudre les problèmes sont des qualités qui seront particulièrement appréciées. Le candidat devra parler anglais, le français n’étant pas un prérequis.

https://www.irim.cnrs.fr/index.php/en/researchh/teams/membrane-dynamics-viruses

Le contrat est pour un an renouvelable. Début du contrat : début/mi 2019

Les candidatures sont à adresser à R. Gaudin: raphael.gaudin(at)irim.cnrs.fr


3-year postdoc position available on innate immunity and viruses Interferon and Antiviral Restriction Lab (C. Goujon’s team)

Institut de Recherche en Infectiologie de Montpellier, France

The Interferon and Antiviral Restriction Lab, led by Caroline Goujon, is recruiting a talented and highly motivated postdoctoral fellow with expertise in the fields of innate immunity and/or virology to work on the ANTIViR ERC-funded project. This project aims at understanding the mechanisms of interferon-induced antiviral restriction and signaling, focusing on two major pathogenic viruses, HIV-1 and influenza A virus.

Applicants must hold a PhD degree in Life sciences. An excellent knowledge of influenza A virus biology and/or innate immunity is absolutely required, and expertise in super resolution microscopy and/or bioinformatics would be a plus.
Candidates should send their application, CV (including a publication list) and contact of 2 to 3 referees to: caroline.goujon(at)irim.cnrs.fr

Deadline: December 2018
Starting: January / February 2018

Selected publications:

Tomas Doyle, Olivier Moncorgé, Boris Bonaventure, Darja Pollpeter, Marion Lussignol, Marine Tauziet, Luis Apolonia, Maria-Teresa Catanese, Caroline Goujon* and Michael H. Malim* (* co-senior, co-corresponding authors). The interferon inducible isoform of NCOA7 inhibits endosome-mediated viral entry. Nature Microbiology, in press (http://dx.doi.org/10.1038/s41564-018-0273-9).

Doyle, T., Goujon, C., and Malim, M.H. (2015). HIV-1 and interferons: who’s interfering with whom? Nature Reviews Microbiology 13, 403-413.


Post-Doctoral position in phosphate homeostasis and calcification at IRIM, Montpellier, France

A post-doctoral position funded by the French National Agency of research (ANR) is open for a talented and highly motivated post-doc fellow to study cellular phosphate homeostasis and its misregulation leading to vascular calcification.

Phosphate is an important mineral for the synthesis of membranes and nucleic acids, for energy production and signal transduction, and its concentration is tightly regulated by phosphate transporters. Little is known about how human and other metazoan cells sense phosphate to regulate phosphate homeostasis and metabolism. We are particularly interested in XPR1, a retroviral receptor that we found to mediate phosphate efflux and to be associated with a rare disease called primary familial brain calcification (PFBC). The objective of the post-doctoral project is to understand how XPR1 is integrated in this regulated sensing process and why mutations in the XPR1 gene can lead to phosphate-associated disorders like calcification. The successfull applicant will use a broad range of technics, in particular genome modifications and genetic screens, solute transport assays, as well as calcification assays in in vitro and in vivo models..

1- Giovannini D., Touhami J., Charnet P., Sitbon M.*, Battini JL.* 2013. Inorganic phosphate export by the retrovirus receptor XPR1 in metazoans. 2013. Cell Reports 3: 1866-73.
2-  Legati A., Giovannini D., …, Geschwind DH., Battini JL.*, Coppola G*. 2015. Mutations in XPR1 cause primary familial brain calcification associated with altered phosphate export. Nature Genetics 47: 579–581.

Context:

The candidate will be part of the CALCIPHOS ANR project, organized as an interdisciplinary research program between the Labs of Jean-Luc Battini/Laurence Briant (IRIM, CNRS UMR9004, Montpellier), Marc Sitbon (IGMM, CNRS UMR5535, Montpellier) and Gaël Nicolas/Dominique Campion (INSERM U1245, Rouen). She/he will benefit from a highly dynamic and collaborative environment at the « route de Mende » CNRS campus of Montpellier and from state-of-the-art technological platforms.

Profil:

Candidates are expected to be autonomous, enthusiastic, and able to work in a collaborative team. Experience in cell and molecular biology, biochemistry and imaging is required as well as good communication skills in english. An expertise in animal studies and histology as well as a background in calcification/mineralization would be appreciated. The position is funded for 2 years and salary will be based on experience.

Applicants must hold a PhD degree in biology and should send a letter of scientific achivements and of their interest in this project, a CV with list of publications, and contact informations of 2 referees to jean-luc.battini(at)irim.cnrs.fr

Deadline: December 2017

Starting: January / February 2018


L’équipe de Laurent Kremer recherche un post-doc en mycobactériologie pour 2 ans dans le cadre d’un projet financé par le LabEx EpiGenMed.

La paroi mycobactérienne représente une structure complexe constituée de lipides atypiques qui agissent comme immunomodulateurs et facteurs de virulence. Une meilleure compréhension des enzymes impliquées dans l’export de ces lipides nous renseignerait sur la biogenèse de la paroi.

Nous avons récemment obtenu des informations fonctionnelles et structurales sur une famille de transporteurs lipidiques, les protéines de la famille MmpL, qui appartiennent à la superfamille des pompes à efflux. Mycobacterium abscessus, un pathogène émergent dans la mucoviscidose possède au moins 29 MmpLs dont les fonctions restent largement inexplorées. Ce projet consistera à générer des mutants dans des gènes codant des MmpLs et d’analyser leur phénotype en relation avec (i) la biosynthèse de la paroi ; (ii) la contribution individuelle de chacun de ces transporteurs dans la phagocytose et la survie intramacrophagique; (iii) leur rôle dans physiopathologie des infections à M. abscessus dans l’embryon de zebrafish; (iv) leur implication dans la résistance/susceptibilité aux antibiotiques.


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