L'équipe VTRIS se passionne pour une meilleure compréhension du transport des virus entre les compartiments cellulaires et de l'interaction entre les virus et l'immunité innée, tant au niveau des cellules immunitaires innées (cellules dendritiques, macrophages, cellules lymphoïdes innées) qu'au niveau des voies de signalisation qui sont déclenchées par la détection des virus lors de l’infection. Si l'immunité innée constitue une puissante première ligne de défense contre les agents pathogènes, une réponse trop forte ou persistante peut également être délétère pour l'hôte. Ces thèmes sont les fondements des 3 principaux projets de notre équipe.
Axe 1- Transport nucléo-cytoplasmique (Nathalie Arhel)
Le pore nucléaire régule le passage de macromolécules entre le cytoplasme et le noyau. Notre équipe a plusieurs projets en cours afin de mieux comprendre comment la biologie du pore nucléaire contribue à l'infection et à l'immunité innée.
(1) Le pore nucléaire constitue un passage obligatoire pour de nombreux virus qui se répliquent dans le noyau. En utilisant le VIH comme modèle, nous cherchons à mieux comprendre comment le pore nucléaire contribue à une infection productive, en nous concentrant à la fois sur les composants structurels du pore nucléaire, tels que les nucléoporines, et sur les transporteurs solubles tels que TRN-1/TNPO1. Nous utilisons ensuite ces connaissances pour développer des inhibiteurs du transport nucléaire viral.
(2) Nous cherchons à mieux comprendre comment les troubles génétiques de la machinerie du pore nucléaire contribuent à la maladie. En utilisant des modèles in vitro et des biopsies de patients, nous nous concentrons sur les mutations autosomiques dominantes dans les gènes codant pour les composants de la machinerie de transport nucléaire, tels que les karyophérines et les nucléoporines, et nous essayons de comprendre comment celles-ci déséquilibrent notre réponse immunitaire suite à une infection virale.
Axe 2- Immunité innée antivirale (Sébastien Nisole)
Notre équipe est spécialisée dans les sous-types de cellules dendritiques rares et spécialisées.
(1) Les cellules de Langerhans et les DCs dermiques résident dans la peau et les muqueuses. Nous menons plusieurs projets afin de mieux comprendre comment ces cellules résistent aux infections virales, et si elles peuvent être infectées de manière productive et contribuer à la propagation virale. Nous nous intéressons particulièrement aux arbovirus qui sont propagés par les moustiques et sont donc transmis directement par la peau (virus du Nil occidental, Usutu, Zika et Dengue), ainsi qu'au VIH-1 qui est en contact avec ces cellules dendritiques spécialisées dans les muqueuses.
(2) Les cellules dendritiques plasmacytoïdes circulent dans le sang et sont les principaux producteurs d'interféron. Nous avons un fort intérêt à mieux comprendre comment elles régulent la réponse antivirale globale, par exemple après une infection par le virus de la grippe A, et à caractériser les facteurs cellulaires qui les rendent réfractaires à une infection productive.
Axe 3- Crible haut-débit Alpha Centauri (Nathalie Arhel & Sébastien Nisole)
Notre équipe a développé plusieurs tests basés sur la complémentation protéique pour mesurer les changements de compartiments subcellulaires survenant au cours des infections ou du déclenchement de la réponse immunitaire innée. Ces tests ont été conçus et miniaturisés pour être compatibles avec le criblage à haut-débit. Une jeune Start-up offrira des solutions personnalisées aux clients qui recherchent de nouveaux tests pour identifier des modulateurs de l'immunité innée, basés sur la translocation nucléaire de facteurs de transcription-clés. Notre équipe académique poursuit des développements en appliquant ces tests pour identifier des molécules antivirales à large spectre contre différents virus à ARN, comme le virus de la grippe, le virus West Nile, le SARS-CoV-2 ou le VIH-1.
L'équipe en Mars 2022
De gauche à droite: N. Arhel, E. Arsac,S. Nisole, P. Gonin, A. Decorsière, M. Cartron, A. Vidal, A. Boulay, J. Zoladek, C. Chamontin.
L'équipe en Mars 2021
De gauche à droite: C. Chamontin, N. Arhel, S. Nisole, M.F. Martin, H. Abiven, G. Maarifi, J. Fernandez, P. Nouaux, E. Gerber-Tichet, A. Boulay, Q. Hertel, F. Blanchet.
Membres de l’équipe
Nathalie Arhel - Chercheur CNRS
Sébastien Nisole - Chercheur INSERM
Adrien Decorsière - Chercheur CNRS
Jim Zoladek - Chercheur post-doctoral, ANR
Sophie Desgraupes - Chercheuse post-doctorale, ANRS
Suzon Perrin - Assistante Ingénieure
Inès Bribes - Doctorante CBS2 Montpellier
Marion Cannac - Stagiaire de 4e année de diplôme de l’ENS de Lyon
Thomas Léocadie - Etudiant M2, ENS Saclay
Emmanuel Quevarec - Etudiant M2, ENSCM
Benoît Gouy - Etudiant M1, ENS Lyon
Chloé Fournie - Etudiante M1, Université de MontpellierIls ont travaillé avec nous (VTRIS Alumni)
Célia Chamontin - Assistante Ingénieure, Université de Montpellier, 2017-2022
Pauline Gonin, Etudiante M2 (Université de Montpellier), 2022
Mateo Cartron, Etudiant M2 (Université de Rennes), 2022
Emma Arsac, Etudiante M2 (Université de Montpellier), 2022
Amélie Vidal, Etudiante M1 (Université de Montpellier), 2022
Aude Boulay, Assistante Ingénieure, Sidaction, 2020-2022
Ghizlane Maarifi, Postdoc ANRS, 2019-2021
Marie-France Martin, Doctorante CBS2 Montpellier, Labex EpiGenMed, 2018-2021
Fabien Blanchet, Chercheur INSERM, 2019-2022
Quentin Hertel, Doctorant CBS2 Montpellier, 2020-2022
Camille Talercio, Etudiante M1 (Université de Montpellier), 2021-2022
Pierre Nouaux, Assistant Ingénieur, SATT AxLR, 2021
Elina Gerber-Tichet, Etudiante M2 (Université de Montpellier), 2021
Hervé Abiven, Etudiant 5e année, Ecole de Biologie Industrielle, 2021
Juliette Fernandez, Doctorante Sidaction / Ingénieur d'études, SATT AxLR, 2017-2021
Sarah Maillet, Doctorante, ANRS, 2017-2020
Carla Alemany, Etudiante L3 (Université de Montpellier), 2020
Lina Lapeyre, Etudiante M2 (Université de Montpellier), 2020
Anne-Claire Aurilio, Etudiante M1 (Université de Montpellier), 2019-2020
Justine Lagisquet, IE Recherche, 2017-2019
Willy Lutz, Etudiant L3 (Université de Nîmes), 2019
Richard de Reuver, Etudiant M2 Erasmus (Leiden University, Pays-Bas), 2018
Samah Sharif, Etudiante M1 (Université de Montpellier), 2018
Abderezak Zebboudj, Postdoc, 2017-2018Publications 2015-2022
2022
- Vitour D, Nisole S, Lévêque N, Saulnier A, Tordo N, Gatignol A, Gilmer D. Une année dans Virologie : des virus persistent, d’autres émergent. Virologie. 2022, 26(6):405-408.
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- Fernandez J, Portilho DM, Danckaert A, Munier S, Becker A, Roux P, Zambo A, Shorte S, Jacob Y, Vidalain PO, Charneau P, Clavel F, Arhel NJ. Microtubule-associated proteins 1 (MAP1) promote human immunodeficiency virus type I (HIV-1) intracytoplasmic routing to the nucleus. J Biol Chem. 2015, 290(8):4631-46.
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- Brantis-de-Carvalho CE, Maarifi G, Gonçalves Boldrin PE, Zanelli CF, Nisole S, Chelbi-Alix MK, Valentini SR. MxA interacts with and is modified by the SUMOylation machinery. Exp Cell Res. 2015, 330(1):151-63.
- Kotera N, Dubost E, Milanole G, Doris E, Gravel E, Arhel N, Brotin T, Dutasta JP, Cochrane J, Mari E, Boutin C, Léonce E, Berthault P, Rousseau B. A doubly responsive probe for the detection of Cys4-tagged proteins. Chem Commun. 2015, 51(57):11482-4.
- Blondel D, Maarifi G, Nisole S, Chelbi-Alix M. Resistance to Rhabdoviridae Infection and Subversion of Antiviral Responses. Viruses. 2015, 7:3675-702.
Locales
- Sara SALINAS & Yannick SIMONIN, INSERM U1058, Montpellier
- Nadir MECHTI & Georges LUTFALLA, DIMNP, Montpellier
- Matteo BONAZZI, Caroline GOUJON & OLivier MONCORGE, IRIM, Montpellier
- Sébastien LYONNAIS & Delphine MURIAUX, CEMIPAI, Montpellier
Nationales
- Jean-Philippe HERBEUVAL, Faculté des Saints-Pères, Paris
- Nicolas LEVEQUE & Charles BODET, CHU de Poitiers
- Etienne DECROLY, AFMB, Marseille
- Pierre-Olivier VIDALAIN, CIRI, Lyon
- Anne-Sophie BEIGNON, CEA Fontenay-aux-Roses
- Jean-Pierre LEVRAUD, Institut Pasteur, Paris
Internationales
- Franck KIRCHHOFF, Institute of Molecular Virology, Ulm, Allemagne
- Yohei YAMAUCHI, Medical School, University of Bristol, UK
- Sam WILSON, Centre for Virus Research, Glasgow, UK
- Dominique GARCIN, Université de Genève, Suisse
- Pepe ALCAMI, Centro Nacional de Microbiología, Madrid, Espagne
- Décembre 2022: Célébration de la promotion de Célia Chamontin avec les collègues.
- Septembre 2022: La pipette d'or revient enfin à la maison, après 3 ans d'absence!! 
"It came back to us… our own, our precious!!"
L'équipe VTRIS remporte le challenge inter-équipes 2022 de l'IRIM avec cette photo:
- Août 2022 : Comment les moustiques nous piquent (et les conséquences) dans "The Conversation".
- Juillet 2022: Postdoc à pourvoir dans l'équipe!
- Juin 2022: Notre papier récemment publié dans Cell Chem Biol (voir précédent post) a été présenté dans "This Week In Virology"!!
Cliquez ci-dessous pour voir Vincent Racaniello et ses co-animateurs expliquer notre article et la technologie Alpha Centauri (à partir de 39'55'') :
- June 2022: Encore un triple combo pour l'équipe VTRIS, qui publie 3 papiers coup sur coup!
- Maarifi G et al. Identifying enhancers of innate immune signaling as broad-spectrum antivirals active against emerging viruses. Cell Chem Biol (2022).
- Mac Kain A et al. Identification of DAXX as a restriction factor of SARS-CoV-2 through a CRISPR/Cas9 screen. Nat Commun (2022).
- Martin MF et al. Usutu Virus escapes langerin-induced restriction to productively infect human Langerhans cells, unlike West Nile virus. Emerg Microbes Infect (2022).
- Mars 2022: Nathalie Arhel présente ses derniers travaux lors de la Journée Scientifique de Sidaction, à l'Institut Pasteur.
- Mars 2022: Aujourd'hui, c'est Mardi-gras au labo!!
- Novembre 2021: L'équipe VTRIS est très heureuse d'accueillir un nouveau chercheur, Adrien Decorsiere. Adrien s'intéresse à la transcription des gènes extra-chromosomiques, comme les épisomes du virus de l'hépatite B, et aime explorer de nouvelles technologies pour étudier la dynamique des ARN. Bienvenue Adrien, nous sommes vraiment impatients de travailler avec toi !
- Octobre 2021: On recrute!
- Avril 2021: On parle de notre projet de start-up, Alpha-Centauri, dans le Midi Libre.
- Mars 2021: Une belle matinée dans la garrigue.
- Novembre 2020: Après une brillante visio-sountenance, Sarah Maillet se voit décerner le titre de Docteur! Bravo Sarah!!
- July 2020: Quentin Hertel décroche une bourse de thèse au concours de l'école doctorale CBS2. Bien joué, Quentin!! Nous sommes ravis que tu restes 3 ans de plus dans l'équipe!
- Juin 2020: Un grand merci à l'ANR et la Région Occitanie de financer notre projet Alpha-CoV, qui vise à mettre en œuvre un test rapide et fiable pour le criblage haut-débit de molécules antivirales actives contre le SARS-CoV-2.
- Mars/Avril 2020: L'équipe VTRIS garde le contact malgré le confinement.
- Février 2020: Juliette Fernandez reçoit le trophée i-PhD 2019 des mains de Frédérique Vidal, Ministre de l'Enseignement supérieur, de la Recherche et de l'Innovation. Félicitations, Juliette !! 
Les 29 lauréats du trophée i-PhD
- Février 2020: Nathalie Arhel et Sébastien Nisole participent au congrès "Viruses - Novel Concepts in Virology" à Barcelone.
Pouvez vous nous trouver?
Nathalie préside la session "Viral genetics and evolution"
- Novembre 2019: Un grand bravo à notre nouveau Dr, Juliette Fernandez, qui a brillamment défendu sa thèse! On est tous fiers de toi, Juliette!
- Octobre 2019: Sébastien Nisole est éditeur invité d'un numéro spécial du journal Viruses intitulé "Facteurs antiviraux intrinsèques". Les soumissions sont maintenant ouvertes et nous attendons vos contributions!
Date limite de soumission: 1er novembre 2020
Pour de plus amples informations, merci de visiter la page web dédiée à ce numéro:
https://www.mdpi.com/journal/viruses/special_issues/antiviral_factors
- Septembre 2019: Après 3 ans d'efforts, la très convoitée pipette d'or est enfin à nous...!!!
"It came to us, our own, our love... our precioussss!!"
L'équipe VTRIS remporte le challenge inter-équipes 2019 de l'IRIM avec cette photo: 
Le Making-of:
- Septembre 2019: Ce n'est pas 1, ni 2, mais bien 3 papiers de l'équipe VTRIS qui viennent d'être acceptés pour publication... super rentrée!!
- Juillet 2019: Sarah Maillet, Célia Chamontin et Juliette Fernandez participent aux défis sportifs organisés pour les 80 ans du CNRS, au sein de l'équipe dIRIM Team!
- Mars 2019: L'IRIM arrive en force aux Journées Francophones de Virologie, à l'ENS Lyon. Juliette Fernandez y présente les travaux de l'équipe sur le rôle de TNPO1 dans le désassemblage et l'import nucléaire du VIH-1. 
- Mars 2019: Nathalie Arhel, Célia Chamontin et Sébastien Nisole se joignent à l'équipe "IRIM Greyhound" pour le marathon de Montpellier en relais! 42,2km en 3h53... bien joué les lévriers!!
- Janvier 2019: Sitôt arrivé, sitôt financé! Fabien Blanchet vient d'obtenir un financement auprès de l'ANRS pour poursuivre son projet de recherche sur la restriction du VIH-1 dans les cellules de Langerhans. Bien joué, Fabien!!
- Décembre 2018: Nous sommes ravis d'accueillir un nouveau PI dans l'équipe, Fabien Blanchet, CR INSERM et spécialiste des cellules myeloïdes, de l'immunité antivirale et du VIH. Il nous rejoint accompagné de Ghizlane Maarifi, post-doc financée par l'ANRS. Nous leur souhaitons une chaleureuse bienvenue!
- Décembre 2018: Nathalie Arhel et Sébastien Nisole participent au congrès "Immunotherapies for Infectious Diseases" organisé à Lyon.
- Octobre 2018: L'équipe VTRIS au concours "Top Chef" de l'IRIM.
De gauche à droite: J. Fernandez, S. Maillet, G. Maarifi.
- Septembre 2018: Nathalie Arhel organise un workshop très stimulant au Domaine de Verchant, avec le soutien de l'ANR.
- Juin 2018: Marie-France Martin obtient un financement de 3 ans auprès du Labex EpigenMed pour étudier la réponse immunitaire innée des arbovirus dans les cellules immunitaires humaines. Félicitations et bienvenue Marie-France!
- Mai 2018: Juliette Fernandez organise à l'IRIM, pour la première fois en région Occitanie, le congrès des Apprentis Chercheurs pour le compte de l'association l'Arbre des Connaissances. Des binômes de collégiens et lycéens ont eu l'opportunité de découvrir le travail en laboratoire tout au long de leur année scolaire et ont ensuite présenté leurs résultats devant leur famille et leurs professeurs lors d'un congrès organisé dans l'amphithéâtre du CNRS. Un grand merci aux équipes de l'IRIM qui ont accueilli ces chercheurs en herbe dans leur laboratoire.
- Avril 2018: Les membres de l'équipe VTRIS se joignent à la Team IRIM pour participer à la "Ruée des Fadas", une course d'obstacles de 8 km.
- Avril 2018: L'équipe acueille Richard de Reuver, étudiant hollandais en Master Erasmus, qui vient réaliser un stage de 6 mois. Bienvenue Richard!
- Février 2018: Nathalie Arhel et Sébastien Nisole participent au congès "Viruses - Breakthroughs in Viral Replication" à Barcelone.
Qui nous trouvera sur ces photos?
- Octobre 2017: l'équipe VTRIS remporte le 2e prix de la compétition vidéo de l'IRIM. Nous visons le premier prix pour la prochaine compétition, la très convoitée pipette d'or...!
Photo de gauche, de gauche à droite: S. Maillet, J. Fernandez, C. Chamontin, A. Zebboudj, J. Lagisquet
Photo de droite: S. Maillet et J. Fernandez
- Octobre 2017: L'équipe VTRIS est heureuse d'accueillir 2 nouveaux membres, Abderezak Zebboudj (postdoc) et Justine Lagisquet (Ingénieure d'Etudes). Bienvenue à Zak et Justine!
- Septembre 2017: Nous accueillons Célia Chamontin, qui rejoint l'équipe en temps qu'Assistante ingénieure statutaire (Université de Montpellier). Nous sommes ravis de ton arrivée dans l'équipe, Célia!
- Juin 2017: Sarah Maillet obtient un financement de 3 ans auprès de l'ANRS pour réaliser sa thèse au sein de l'équipe. Elle y étudiera le mécanisme moléculaire par lequel la protéine celulaire Daxx inhibe la rétro-transcription du VIH-1. Félicitations, Sarah!
- Mai 2017: Premier Escape game pour l'équipe VTRIS, qui parvient à sortir de la pièce en moins d'1 heure!
De gauche à droite: S. Nisole, N. Arhel, C. Chamontin, J. Fernandez, S. Maillet
- Avril 2017: L'équipe VTRIS participe à une chaîne humaine géante pour former le mot "Science" place du Peyrou à Montpellier. Nous sommes au niveau du 2e "C" de "Science" sur cette photo satellite.
- Mars 2017: Juliette Fernandez tient le stand Sidaction avec Véronique dans le hall de l'IRIM.
- Janvier 2017: Juliette Fernandez obtient un financement de 3 ans pour réaliser sa thèse au sein de l'équipe. Elle y développera des outils innovants pour étudier l'import nucléaire du VIH. Félicitations, Juliette!
- Janvier 2017: Inauguration de l'équipe Trafic viral, Restriction et Immunité innée (VTRIS en anglais, pour "Viral Trafficking, Restriction and Innate Signaling") à l'IRIM.
Responsables
En bref
L'équipe VTRIS a été créée au 1er janvier 2017, suite à un appel d'offres international lancé par l'IRIM. Elle bénéficie depuis sa création du soutien du labex EpiGenMed.
Financements
