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Septembre 2022
Arrivée de Willy Lutz dans l'équipe. Willy va nous aider à traiter nos données grâce à des approches d'intelligence artificielle pour prédire l'impact des virus sur nos échantillons biologiques. Bienvenue !




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Juillet 2022

Soirée escalade après le labo avant le départ de Diane le mois prochain !



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Juin 2022

Soirée plage après le labo pour feter l'anniv d'Emma !





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Juin 2022
Bienvenue à Gaia Cogrossi, étudiante ERASMUS qui va travailler sur le développement d'antiviraux contre les coronavirus.




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Avr 2022
Et voici Yukiko Iwasaki et Joelle Hornebeck. Yukiko est post-doctorante dans l'équipe de Ganesh Gowrishankar (LIRMM, Montpellier), et qui est acceuilli dans notre équipe pour nous aider en programmation, intelligence artificielle et analyses de signaux. Joelle est une étudiante en Master 1 infectiologie qui développe de nouveaux outils de visualisation de virus et bactérie. Pour se faire, elle est à l'interface entre notre équipe et celle de Matteo Bonazzi (IRIM). Bienvenues à ttoutes les deux





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Fev 2022
Bienvenue aux deux nouvelles membres de l'équipe : Dr. Barbara Gorda (Basia) et Dr. Malvina Schatz. Tandis que Basia explorera de nouvaux axes de recherches en neuro-virologie, Malvina va reprendre l'optimisation d'une série de molécules antivirales brevetées pour les emmené vers la prochaine étape de leur développement.
Bienvenue à elle deux !

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Oct 2021

Halloween party !!! Tout le monde avait de super costumes !

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Sept 2021
L'équipe MDV est heureuse d'accueillir Diane Béagrie qui vient de terminer ses études à l'ENS de Lyon. Diane sera ingénieure dans l'équipe, travaillant à l'interface entre neurobiologie et virus en collaboration avec les autres membres de l'équipe.

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Mai 2021
Bienvenue à Khiara Berkowitz-Sklar, étudiante à Princeton University (USA), qui restera avec nous jusqu'à la fin du mois d'Aout. Khiara va travailler sur la biologie moléculaire et cellulaire impliqué dans le transport intracellulaire de protéines cellulaires et virales.

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Mar 2021
Arrivée de Clarisse Montet, qui va réaliser son Master 2 DTech Bio à mi-chemin entre le laboratoire de Benoit Charlot à l'IES Montpellier et chez nous. Elle travaillera sur la fabrication de microcanaux pour former des tubes de cellules endothéliales en 3D.

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Fev 2021
Arrivée de Claire Dupont, ingénieure d'étude qui va travailler à l'interface entre notre équipe et celle de Matteo Bonazzi (IRIM) pour développer de nouveaux outils d'imagerie. Bienvenu Claire !

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Oct 2020
Deux arrivées ce mois-ci dans l'équipe :
Diana Brychka (à gauche), ingénieure d'étude pour 1 an, va poursuivre nos travaux sur le VIH et la transmigration.
Vincent Lucansky (à droite), scientifique Slovaque invité pour 3 mois, va développer des projets de biologie moléculaire dans l'équipe.

 

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Mai 2020
Publication de deux revues scientifiques la même semaine ! Bravo à Emma et Vanesa pour leur travail de rédaction.

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Mai 2020
William Bakhache, étudiant en fin de thèse dans l'équipe de Laurence Briant (IRIM) est recruté en tant qu'ingénieur par la SATT AxlR de Montpellier afin de développer des projets antiviraux au travers d'un mini-consortium à l'IRIM coordonné par Raphael Gaudin, et incluant les groupes de Laurence Briant, Caroline Goujon et Jean-Marie Péloponèse.

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Mar 2020
Fermeture de l'institut suite au confinement imposé dans toute la France. L'équipe, et surtout Maika et Raphael, rejoint ensuite par Yonis, reste à travailler pour faire avancer des projets de développement d'antiviraux à large spectre efficace contre SARS-CoV-2.

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Fev 2020
Sortie en équipe: bowling -> pas de photos, désolé !

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Jan 2020
Bien arrivé : malgré le Brexit, Yonis Bare, qui vient de soutenir sa thèse à King's College London, rejoint notre équipe en tant que post-doctorant. Il va travailler sur la sécrétion de vésicules extracellulaires, et peut-etre même un peu sur le VIH...!

Bienvenu





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Dec 2019

Happy ending: Camille Clément soutien sa thèse le 16 décembre 2019, malgré des grèves qui nous obligent à avoir deux rapporteurs en visioconférence. Mais tout se termine bien et Camille est aujourd'hui fière de se faire appeler Dr. Clément. Félicitations !!!


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Oct 2019

C'est officiel : Emma Partiot débute sa thèse dans l'équipe MDV ! C'est parti pour 3 ans de transmigration !




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Sept 2019

Le "Spicy challenge", organisé par Vanesa a été un franc succès !

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Aout 2019

Nous ne pouvons pas encore dévoiler son nom, mais il semblerait qu'une nouvelle recrue va être acceuillie en Janvier 2020 dans l'équipe ; et ça malgré le Brexit...


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Aout 2019

Nouvelle revue écrite par Maika et Raphael sur l'imagerie live du virus de l'hépatite B publiée dans Trends Microbiol. Congrats!


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Juillet 2019

Le labo a (enfin) son compte twitter : pour + d'actualités sur nos activités et centre d'intérets scientifiques, abonnez-vous : @Gaudinlab

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Mai 2019

Journée labo : Lancer de hache à Castelnau-le-Lez. Pas de blessés à déplorer





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Avr 2019

Nous sommes heureux d'acceuillir Emma Partiot dans notre équipe à partir du 1er Avril 2019. Emma sera amenée à travailler en collaboration avec tous les membres de l'équipe pour initier son projet de thèse en Septembre.



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Dec 2018

Nos récents travaux publiés ont été mis en avant dans le dernier numéro du magazine de l'Inserm :



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Nov 2018

Bravo à Vanesa qui a gagné le 1^er prix de la meilleure présentation orale du SoMM meeting 2018 !




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Nov 2018

Nous sommes heureux d'accueillir Eliott Vernier, étudiant du Master 1 BIOTIN de Montpellier. Il travaillera en lien avec Vanesa et Raphael afin de développer de nouvelles approches méthodologiques (Crispr, microfluidique, ...).




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Oct 2018

Après avoir démarré l’équipe MDV en 2016 en Alsace, nous avons déménagé en direction de Montpellier le 1^er Octobre 2018. Quelques déballages de cartons et plusieurs épisodes cévenols plus tard, nous voilà à nouveau prêts pour continuer nos recherches à l’IRIM, dans un environnement scientifique dynamique et stimulant.

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Journée karting Février 2018

1. Trans-synaptic dwelling of SARS-CoV-2 particles perturbs neural synapse organization and function. Partiot E, Hirschler A, Colomb C, Lutz W, Claeys T, Delalande F, Deffieu MS, Roels REJ, Bons J, Callon D, Andreoletti L, Labrousse M, Jacobs FMJ, Rigau V, Charlot B, Martens L, Carapito C, Ganesh G, Gaudin R^#. BioRxiv. 2022 Sept. doi: 1101/2022.09.13.507484.
2. Clustering and mapping the first COVID-19 outbreak in France. Darques R, Trottier J, Gaudin R, Ait-Mouheb N. BMC Public Health. 2022 Jul. doi: 10.1186/s12889-022-13537-7.
3. Identifying enhancers of innate immune signaling as broad-spectrum antivirals active against emerging viruses. Maarifi G, Martin MF, Zebboudj A, Boulay A, Nouaux P, Fernandez J, Lagisquet J, Garcin D, Gaudin R, Arhel NJ, Nisole S. Cell Chemical Biology. 2022 Jul. doi: 10.1016/j.chembiol.2022.05.009.
4. Occludin stalls HCV particle dynamics apart from hepatocyte tight junctions, promoting virion internalization. Deffieu MS^*, Clément C^*, Dorobantu C, Partiot E, Bare Y, Faklaris O, Rivière B, Ayala-Nunez NV, Baumert TF, Rondé P, Mély Y, Lucansky V, Gaudin R^#. Hepatology. 2022 Apr. doi: 10.1002/hep.32514.
5. Targeting tight junctions to fight against viral neuroinvasion. Gaudin R^#, Brychka D, Sips GJ, Ayala-Nunez V^#. Trends in Molecular Medicine. 2021 Nov 19:S1471-4914(21)00279-3. doi: 10.1016/j.molmed.2021.10.007.
6. Pharmacological perturbation of intracellular dynamics as a SARS-CoV-2 antiviral strategy. Bakhache W, Partiot E, Lucansky V, Bare Y, Bonaventure B, Goujon C, Bories C, Deffieu MS, Gaudin R^#. 2021 Sept. BioRxiv. doi: 10.1101/2021.09.10.459410.
7. [Will we read the future of COVID-19 in wastewater?]. Gaudin R^#, Lepeuple AS. Virologie (Montrouge). 2021 Feb 1;25(1):5-7. doi: 10.1684/vir.2021.0875.
8. Rab7-harboring vesicles are carriers of the transferrin receptor through the biosynthetic secretory pathway. Deffieu MS^#, Cesonyte I, Delalande F, Boncompain G, Dorobantu C, Song E, Lucansky V, Hirschler A, Cianferani S, Perez F, Carapito C, Gaudin R^#. Science Advances. 2021 Jan 8;7(2):eaba7803. doi: 10.1126/sciadv.aba7803.
9. Tracking Mechanisms of Viral Dissemination In Vivo. Gaudin R^#, Goetz JG^#. Trends in Cell Biology. 2021 Jan;31(1):17-23. doi: 10.1016/j.tcb.2020.09.005
10. Post-lockdown detection of SARS-CoV-2 RNA in the wastewater of Montpellier, France. Trottier J, Darques R, Ait Mouheb N, Partiot E, Bakhache W, Deffieu MS, Gaudin R^#. One Health. 2020 Dec; 10:100157. doi: 10.1016/j.onehlt.2020.100157.
11. Mapping Cell Membrane Organization and Dynamics Using Soft Nano-Imprint Lithography. Sansen T, Sanchez Fuentes D, Rathar R, Colom A, El Alaoui F, Viaud J, Macchione M, de Rossi S, Matile S, Gaudin R, Bäcker V, Carretero-Genevrier A, Picas L. ACS Appl Mater Interfaces. 2020 May 28. doi: 10.1021/acsami.0c05432.
12. [Monocytes and Zika virus: the brain's conquest]. Partiot E & Gaudin R^#. Medecine/Sciences (Paris). 2020 May;36(5):449-451. doi: 10.1051/medsci/2020072. Epub 2020 May 26.
13. A viral journey to the brain: Current considerations and future developments. Ayala-Nunez NV & Gaudin R^#. PLoS Pathogens. 2020 May 21;16(5):e1008434. doi: 10.1371/journal.ppat.1008434.
14. Characterisation of endogenous Claudin-1 expression, motility and susceptibility to hepatitis C virus in CRISPR knock-in cells. Clément CMH*, Deffieu MS*, Dorobantu CM, Baumert TF, Ayala-Nunez NV, Mély Y, Ronde P, Gaudin R^#. Biology of the Cell. 2020 Feb 7. doi: 10.1111/boc.201900085.
15. Dynamics of Auxilin 1 and GAK in clathrin-mediated traffic. He K, Song E, Upadhyayula S, Dang S, Gaudin R, Skillern W, Bu K, Capraro BR, Rapoport I, Kusters I, Ma M, Kirchhausen T. Journal of Cell Biology. 2020 Mar 2;219(3). pii: e201908142. doi: 10.1083/jcb.201908142.
16. Zika virus enhances monocyte adhesion and transmigration favoring viral dissemination to neural cells. Ayala-Nunez NV, Follain G, Delalande F, Hirschler A, Partiot E, Hale GL, Bollweg BC, Roels J, Chazal M, Bakoa F, Carocci M, Bourdoulous S, Faklaris O, Zaki SR, Eckly A, Uring-Lambert B, Doussau F, Cianferani S, Carapito C, Jacobs FMJ, Jouvenet N, Goetz JG, Gaudin R^#. Nature Communications. 2019 Sep 27;10(1):4430. doi: 10.1038/s41467-019-12408-x.
17. Imaging the Hepatitis B Virus: Broadcasting Live. Deffieu MS & Gaudin R^#. Trends in Microbiology. 2019 Aug 14. pii: S0966-842X(19)30191-X. doi: 10.1016/j.tim.2019.07.007.
18. Molecularly Distinct Clathrin-Coated Pits Differentially Impact EGFR Fate and Signaling. Pascolutti R, Algisi V, Conte A, Raimondi A, Pasham M, Upadhyayula S, Gaudin R, Maritzen T, Barbieri E, Caldieri G, Tordonato C, Confalonieri S, Freddi S, Malabarba MG, Maspero E, Polo S, Tacchetti C, Haucke V, Kirchhausen T, Di Fiore PP, Sigismund S. Cell Reports. 2019 Jun 4;27(10):3049-3061.e6. doi: 10.1016/j.celrep.2019.05.017.
19. Hypoxia induced human deoxyribonuclease I is a cellular restriction factor of hepatitis B virus. Hallez C, Li X, Suspène R, Thiers V, Bouzidi1 MS, Dorobantu C, Lucansky V, Wain-Hobson S, Gaudin R^#, Vartanian JP^#. Nature Microbiology. 2019 Apr 1. doi: 10.1038/s41564-019-0405-x.
20. Minimal information for studies of extracellular vesicles 2018 (MISEV2018): a position statement of the International Society for Extracellular Vesicles and update of the MISEV2014 guidelines. Théry C, Witwer KW, …, Gaudin R, … (> 300 authors). Journal of Extracellular Vesicles. 2018 Nov 23;7(1):1535750. doi: 10.1080/20013078.2018.1535750
21. The actin cytoskeletal architecture of estrogen receptor positive breast cancer cells suppresses invasion. Padilla-Rodriguez M, Parker SS, Adams DG, Westerling T, Puleo JI, Watson AW, Hill SM, Noon M, Gaudin R, Aaron J, Tong D, Roe DJ, Knudsen B, Mouneimne G. Nature Communication. 2018 Jul 30;9(1):2980. doi: 10.1038/s41467-018-05367-2.
22. The ESCRT-III Protein CHMP1A Mediates Secretion of Sonic Hedgehog on a Distinctive Subtype of Extracellular Vesicles. Coulter ME*, Dorobantu CM*, Lodewijk GA*, Delalande F, Cianferani S, Ganesh VS, Smith RS, Lim ET, Xu CS, Pang S, Wong ET, Lidov HGW, Calicchio ML, Yang E, Gonzalez DM, Schlaeger TM, Mochida GH, Hess H, Lee WA, Lehtinen MK, Kirchhausen T, Haussler D, Jacobs FMJ^#, Gaudin R^#, Walsh CA^#. Cell Reports. 2018 Jul 24;24(4):973-986.e8. doi: 10.1016/j.celrep.2018.06.100.
23. Blood monocytes sample MelanA/MART1 antigen for long-lasting cross-presentation to CD8+ T cells after differentiation into dendritic cells. Faure F, Jouve M, Lebhar-Peguillet I, Sadaka C, Sepulveda F, Lantz O, Berre S, Gaudin R, Sánchez-Ramón S, Amigorena S. International Journal of Cancer. 2018 Jan 1;142(1):133-144. doi: 10.1002/ijc.31037.
24. Dynamics of phosphoinositide conversion in clathrin-mediated endocytic traffic. He K, Marsland R, Upadhyayula S, Song E, Dang S, Capraro BR, Wang W, Skillern W, Gaudin R, Ma M and Kirchhausen T. Nature. 2017 Dec 13. doi: 10.1038/nature25146. Highlighted in F1000Prime.
25. Inhibition of JCPyV infection mediated by targeted viral genome editing using CRISPR/Cas9. Chou YY, Krupp A, Kaynor C, Gaudin R, Ma M, Cahir-McFarland E, Kirchhausen T. Scientific Reports. 2016 Nov 14;6:36921. doi: 10.1038/srep36921.
26. Membrane dynamics of dividing cells imaged by lattice light-sheet microscopy. Aguet F*, Upadhyayula S*, Gaudin R*, Chou YY, Cocucci E, He K, Chen BC, Mosaliganti K, Pasham M, Skillern W, Legant WR, Liu TL, Findlay G, Marino E, Danuser G, Megason S, Betzig E, Kirchhausen T. Molecular Biology of the Cell. 2016 Nov 7;27(22):3418-3435. Highlighted.
27. Solute Carrier NTCP Regulates Innate Antiviral Immune Responses Targeting Hepatitis C Virus Infection of Hepatocytes. Verrier ER, Colpitts CC, Bach C, Heydmann L, Zona L, Xiao F, Thumann C, Crouchet E, Gaudin R, Sureau C, Cosset FL, McKeating JA, Pessaux P, Hoshida Y, Schuster C, Zeisel MB, Baumert TF. Cell Reports. 2016 Oct 25;17(5):1357-1368. doi: 10.1016/ j.celrep.2016.09.084.
28. Identification and characterization of a novel broad spectrum virus entry inhibitor. Chou YY, Cuevas C, Carocci M, Stubbs SH, Ma M, Cureton DK, Chao L, Evesson F, He K, Yang P, Whelan SP, Ross SR, Kirchhausen T^#, Gaudin R^#. Journal of Virology. Feb 2016. doi: 10.1128/JVI.00103-16.
29. [Enhancing our single molecule experience using Crispr]. Gaudin R. Médecine/Sciences. Nov 2015 31(11):959-61. doi: 10.1051/medsci/20153111007. Highlighted.
    
30. Sorting of small infectious virus particles by flow virometry reveals distinct infectivity profiles. Gaudin R^# and Barteneva NS^#. Nature Communications. Feb 2015 2;6:6022. doi: 10.1038/ncomms7022.

• Sarah Cianferani, Christine Carapito, François Delalande & Aurélie Hirschler - LSMBO, Strasbourg
• Jacky Goetz - INSERM U1109, Strasbourg
• Pascal Thérond, Institut de Biologie Valrose (IBV), Université de Nice, France
• Nolwenn Jouvenet - Institut Pasteur, Paris
• Franck Perez & Gaelle Boncompain - Institut Curie, Paris
• Grégory Lavieu - Institut Curie, Paris
• Pablo Vargas - Institut Curie, Paris
• Benoit Charlot - IES, Montpellier
• Orestis Faklaris - MRI, Montpellier
• Ganesh Gowrishankar - LIRMM, Montpellier
• Frank Jacobs - University of Amsterdam, The Netherlands
• Eli Song - Institute of Biophysics, Chinese Academy of Science, Beiging, China

We are looking for a motivated post-doctoral scientist to join the research team “Membrane dynamics & viruses” (MDV) headed by Raphael Gaudin, part of the IRIM UMR9004 - CNRS research institute, Montpellier, France. Our lab is interested in various aspects of intracellular trafficking pathways in health and disease. In particular, we are currently studying secretion of biological entities out of the cells, including extracellular vesicles and viruses. We recently discovered a novel extracellular vesicle subtype containing Sonic Hedgehog (Shh) we called ART-EVs (Coulter, Dorobantu et al. Cell Rep, 2018) and we aim to better characterize these vesicles and their secretory route. The proposed project will take advantage of state-of-the-art imaging techniques, Crispr-Cas9 strategies and other innovative approaches mastered in the lab.

Key words: Exosomes; Extracellular vesicles; Intracellular trafficking; Membrane dynamics; Secretion

Profile and skills of the candidate: You are going to defend or already hold a PhD in Cell biology with experience in membrane trafficking. Previous experience with exosomes or extracellular vesicles is a plus. You are curious, motivated and have a problem-solving mindset. The successful candidate is expected to perform bench work and communicate his/her results through internal and external seminars. The project will be conducted in collaboration with two other labs with in vivo and proteomics expertise. The applicant is expected to speak English, while French is not a prerequisite.